故事讲述赛尔先锋战斗小队在帕索尔星帮助麒麟夺回火之翼后，麒麟告诉赛尔先锋小队去巨石星卡图冈之门自然会找到无尽能源的答案，赛尔先锋战斗小队依照麒麟提示，前往巨石星去寻找卡图冈之门事。战神联盟也将登场。盖亚的哥哥瑞尔斯以新形象亮相和重要角色身份再次登场。

由赛小息、阿铁打、卡璐璐组成的赛尔先锋战斗小队和战神联盟找到了雷伊失散多年的师兄艾里克，并找到了赫尔卡星的三颗核心能源，可是艾里克曾经带走的雌无尽能源已经赠与了传说中的麒麟。于是赛小息一行人便开始了寻找麒麟之旅。

从前，在神秘森林里有个外星小孩儿，他带着面具，机灵古怪，终日与吹泡泡的毛猴儿们为伴。 某日，一群凶残至极的鲨齿狼冲进森林，只见头狼身上坐着宇宙精灵捕手克拉，与正在寻找圣者谱尼的SPT队员们撞个正着。 一场上天入地的激战就此展开！ 一路上SPT队员们偶遇食人鲨、野猪、圣光彩蝶、闪光比波、利牙鱼、蘑菇怪…… 孰敌孰友？他们能顺利找到谱尼，开启赛尔号的下个征程吗？

自从谱尼失踪后，宇宙强盗的势力迅速扩张，赛小息、阿铁打和卡璐璐再也没有完成过一次像样的任务，昔日的英雄小队风光不再。后来，三人只好去了宇宙垃圾场，每天一起清理垃圾…… 一晃10年过去了…… 这一天，赛尔号船长重新召回赛小息、阿铁打和卡璐璐，告诉他们谱尼其实还活着。这个消息让赛小息三人又是惊讶又是兴奋。原来，谱尼离开前曾经给了船长一把钥匙，只要在谱尼的故乡万圣星找到圣灵峰，解开谱尼的生死结，谱尼便可重生。听到这里，SPT小队的队员们立刻重新振作出发前往万圣星球，执行找寻谱尼的艰巨任务。没想到的是，船长的这一番话却被强盗阵营的精灵捕手克拉卡知道了，这个家伙阴险狡诈，一直梦想能抓到谱尼。 就这样，克拉卡也来到了万圣星，为了抢夺赛小息手中的钥匙，他一路追杀SPT小队，赛小息三人穿越森林，漂流险滩，与猛兽和恶狼搏斗，历经了千难万险，终于到达了目的地圣灵峰。大反派克拉卡也赶到圣灵峰，一场守护和掠夺的生死大战开始了……

 经过上一季，由赛小息，阿铁打，卡璐璐组成的赛尔先锋小队和战神联盟找到了雷伊失散多年的师兄艾里克，并找到了赫尔卡星的三颗核心能源，可是艾里克曾经带走的雌无尽能源已经赠与了传说中的麒麟。于是赛小息一行人便开始了寻找麒麟之旅。

公元2110年，地球能源枯竭，次品赛尔机器人赛小息在光系精灵米咔的帮助下，带着成为最伟大星际探险员的梦想，和修理型赛尔机器人卡璐璐、战斗型机器人阿铁打组成了赛尔先锋战斗小队，一起登上赛尔号驶向茫茫宇宙，开始了寻找传说中看守着无尽能源的雷伊的冒险……

赛小息与同伴们终于找到了传说中的无尽能源，可又被海盗摧毁了。在绝望之中，又有了希望。他们得知：在宇宙的深处，还有一个无尽能源，由谱尼看守。他们一行人，前往卡兰星系，寻找谱尼。他们会找到无尽能源吗？他们会遇到哈莫雷特，卡修斯，布莱克吗？

讲述英雄再次出击，粉碎邪灵组织的阴谋。不甘于生活在黑暗诅咒之下的布莱克始终与自己的命运做着抗争。这一次，他未来的道路与卡修斯紧紧联系在了一起。 布莱克在赛尔先锋战斗小队的帮助下，寻求着无尽能源。然而，赛尔号对布莱克的误解、自己曾经的遭遇、邪灵组织的一再阻挠让这条自我解救的道路变得无比曲折。 布莱克的我行我素也将卡修斯卷入争斗之中，故事情节因此更加曲折紧张！

为了解决地球能源危机，赛尔号肩负着在太空中发现新能源的使命，在一次又一次的任务中，为地球输送了宝贵的宇宙数据和清洁能源，而主人公赛尔先锋小队又将展开新的探索冒险之旅……在航行途中赛尔号却被一种名为“寒冰”的结界挡住了去路，为了打开结界，赛尔先锋小队来到冰雪星，在这里将会遇到神秘的大雪怪，巨熊星上存在着一颗记录着无尽能源真正奥秘的磁石，为防止宇宙海盗捷足先登，赛尔号集结战神联盟，他们又遇神秘终极对手威斯克…

赛尔号无意中破解了海盗集团的机密信息，由此发现了一个叫做宇宙之眼的神秘天体。并在蒙塔、米咔和神兽不死鸟的帮助下，在三大星球与吉约为首的海盗组织展开较量，最终击败吉约的专属精灵煞星，成功守护三圣宝石，从中获得了宇宙之眼的星际之路。

主要讲述了赛尔号飞船在前往飞龙座星系的途中意外误入了逆世界空间，在逆世界中，由于精灵库迪拉克偷走了乾坤戒指，导致一切万物都处于被逆转状态，同时也让赛尔号遭遇了前所未有的危机，为此星际探险员赛小息、阿铁打、卡璐璐踏上冒险征程，渐渐的三人发现这枚戒指竟关系到谱尼、索伦森与库迪拉克的种种恩怨……戒指最终被成功夺回，逆世界也被恢复正常。当赛尔号抵达飞龙座后选择在龙眼星停靠休整，此时的龙眼星上，海盗迪恩却掠走了霹雳龙哈维，同时哈维与贝娅的孩子小龙恩尼也不幸掉进了危险的天坑。由于缺少了雨露的滋润，龙眼星的环境很快陷入恶化，危急时刻，赛小息三人深入天坑救出了恩尼，最后凭借恩尼的觉醒化解了龙眼星的环境危机，赛尔号也再次踏上征程，朝下一站巨熊座进发!

前往宇宙之眼的赛尔号要穿越一处名为雅丹星云洞的危险区域，但星云洞内被一层梦境结界笼罩，赛尔号深陷其中，临危受命的赛尔先锋小队前往幻梦星找到梦神赫尔墨斯撤销了结界，赛尔号继续前行来到星云洞内的生命树领域，能量告急的赛尔号准备借用生命树的树之灵来补充能量，但此时占据生命树领域的索伦森正抢夺树之灵并试图利用其能量来消灭谱尼.....生命树领域原本是谱尼的修炼之地，谱尼感知到生命树领域的危机后进入了这片领域，索伦森则在抢夺树之灵的同时准备集结手下神域四天王（包括赫尔墨斯）与谱尼决一死战。面对这场危机的赛尔先锋小队决定保护树之灵，拯救生命树!

赛尔号得到无尽能源后返回地球完成使命，不料遇到三巨头，将赛尔号引入飞船坟墓，卡璐璐用丽莎布布的花草护体保护赛尔号，纳斯琪将赛尔号引入永恒冰封暗影黑洞，赛尔先锋小队增加赛尔号动力，逃出黑洞，却不小心进入恐怖的巴斯星。

在始祖灵兽利用无尽能源替布莱克驱逐了体内的黑暗力量后，无尽能源便消失了，正当赛尔先锋小队感到失望时，派特博士无意上发现了幻影金刚的芯片中记录着关于阿瑞斯水晶的传说， 于是战神联盟在赛尔先锋小队的协助下踏上了寻找阿瑞斯水晶的征途，经历了重重磨难，战神联盟终于扫平了阻碍，战胜了也想染指水晶的宇宙海盗和邪恶精灵哈迪斯，在一场公平的对决后，雷伊最终以实力赢得了阿瑞斯水晶并找回了无尽能源。